A continuación, se presenta una breve reseña de las Juntas Directivas y los presidentes de la Federación Salvadoreña de Atletismo a lo largo de su historia. La Federación se fundó en 1946 y ha sido fundamental para el desarrollo y la promoción del atletismo en El Salvador.
El rol del presidente de la Federación es crucial en el funcionamiento y el avance del atletismo en el país. Sin embargo, detrás de cada presidente, hay un grupo de dedicados directivos voluntarios que, son piezas fundamentales de un equipo de trabajo comprometido con el desarrollo de este deporte, los cargos que se incluyen dentro de las directivas son el de vicepresidente, secretario general, tesorero, síndico y vocales. Juntos, asumen una serie de funciones que contribuyen al progreso y la promoción del atletismo.
Entre 1946 y 1947 se realiza la fundación de la Federación Salvadoreña de Atletismo
1966 – *
- Cnel. José Larios Guerra – presidente

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1970 – *
- Don Alfonso Salmerón – Presidente
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1979 – 1981
- Don José Dionisio (Chito) Vega – Presidente
- José González García – Secretario
- Salvador Lemus Simún – Tesorero
- Carlos Eduardo Hasbun – Primer vocal
- Miguel Campos Valle – Segundo vocal
- Francisco Reyes Serrano – Tercer vocal

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1982 – 1983
- Luis Alonso Arias Galeano – Presidente
- Don Ricardo Franco
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1983 – 1984
- Joe Siguí – presidente
- Norman Quijano
- Morgan Bojórquez

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1985 – 1987
- Don Jaime Antonio Comandari – presidente
- Abel Rodríguez

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1987 – 1988
- Arnoldo Villegas – Presidente (renunció, no finalizó su período)
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1988 – 1992
- Dr. Rogelio Chávez – Presidente

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1992 – 2013
- Dr. José Benjamín Ruiz Rodas – presidente
Esta ha sido la gestión más prolongada de un presidente (21 años) y ha contado con el acompañamiento de varios directivos, entre los cuales se encuentran:
- Lic. Raúl Leiva Navidad – secretario general, tesorero
- Prof. Jorge Alberto Ramírez – secretario general, 1° vocal
- Lic. José Adalberto Chorro – secretario general
- Lic. Erick Rivas – secretario general
- Lic. José Mauricio Estévez – tesorero
- Sr. Salvador Escobar – tesorero
- Ing. André Houdelot – tesorero
- Lic. Alejandro García Garay – síndico
- Dr. José Luis Navarro – síndico
- Ing. Ramón Rodríguez – síndico
- Dr. Jorge Alberto Merino – 1° vocal
- Sr. Ricardo Cruz Flores – 2° vocal
- Lic. Ismael Castro Velásquez – 3° vocal
- Lic. Francisco López Torres – vocal
- Licda. Lizzie de Bollman – vocal
- Ing. Víctor Flores – vocal
- Sr. Guillermo López Beltrán – vocal
- Lic. Mauricio Argumedo – vocal
- Lic. Adelio Rosa – vocal
- Lic. Antonio Flamenco – vocal
- Lic. René López Escobar
- Lic. Aldo Fujiwara
- Ing. Joaquín Montenegro


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2013
- Dr. Juan Carlos Ramírez Escobar – Presidente
- Lic. Leopoldo Monterrosa – Vicepresidente
- Lic. Raúl Leiva Navidad – Secretario General
- Sr. Salvador Segundo Escobar – Tesorero
- Sra. Elsa Alvarez de Carrero – Síndica
A inicios del año 2013 se celebró una Asamblea General Extraordinaria, en la cual el Presidente saliente, Dr. José Benjamín Ruiz Rodas, concluyó una gestión de 21 años al frente de la Federación, cediendo la conducción al exatleta y odontólogo Dr. Juan Carlos Ramírez.
Sin embargo, en el mes de agosto de ese mismo año, y en atención a diversas situaciones de carácter administrativo, institucional y financiero heredadas del período anterior, así como a diferencias internas surgidas en el seno de la Junta Directiva entre el presidente y los demás directivos, el Instituto Nacional de los Deportes de El Salvador (INDES) resolvió no reconocer a la Junta Directiva y procedió a la conformación de una Comisión Normalizadora, a la cual se le concedió un plazo de 90 días para la regularización de los aspectos legales, administrativos y técnicos de la Federación.
Esta comisión asumió la tarea de depurar los clubes, revisar estatutos y reglamentos, y organizar elecciones para una nueva Junta Directiva en diciembre de ese mismo año. En dicho proceso electoral participaron los clubes legalmente inscritos, con la supervisión de observadores de CADICA y del INDES. Los resultados fueron los siguientes:
- Dr. Juan Carlos Ramírez Escobar – Presidente
- Licda. Kriscia Lorena García – Vicepresidente
- Ing. Gloria Elizabeth Ramos – Secretaria General
- Sr. José Castillo – Tesorero
- Lic. René Rafael Perla – Vocal

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2013 – 2016
- Dr. Juan Carlos Ramírez Escobar – Presidente
- Lic. René Perla – Vicepresidente
- Ing. Gloria Elizabeth Ramos – Secretaria General, Tesorera
- Ing. Luis Montenegro – Tesorero
- Lic. Carlos Rigoberto Clemente Flores – Síndico, Secretario General
- Licda. Ruth Daniela González – Síndica
Durante la gestión de esta Junta Directiva se presentó un impasse relacionado con el reconocimiento por parte del Comité Olímpico de El Salvador (COES), el cual se prolongó por casi tres años. El COES argumentó que la elección de la Junta Directiva contravenía lo establecido en la Carta Olímpica, la cual dispone que ninguna federación deportiva debe ser intervenida por instancias gubernamentales, al ser estas entidades autónomas. No obstante, dicha Junta contó con el aval del INDES y de la Federación Internacional de Atletismo (IAAF).

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2017 – 2020
- Dr. Juan Carlos Ramírez Escobar – Presidente (reelecto)
- Licda. Ruth Daniela González – Síndica, Vicepresidenta, Presidenta (primera mujer ejerciendo el cargo de presidenta de la Federación, sustituyendo al Dr. Ramírez por renuncia en octubre 2020)
- Lic. Carlos Rigoberto Clemente Flores – Secretario General
- Ing. Gloria Elizabeth Ramos – Tesorera
- Lic. José René Navas Urías – Síndico
- Lic. René Perla – Vicepresidente

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2021 – 2024
- Ing. Gloria Elizabeth Ramos (primera mujer electa como Presidenta de la Federación)
- Licda. Ruth Daniela González – Vicepresidenta
- Lic. Carlos Rigoberto Clemente Flores – Secretario General
- Lic. José René Navas Urías – Tesorero
- Srita. Secia Carolina Rodríguez – Primer Vocal
En la Asamblea General Extraordinaria celebrada en el mes de octubre de 2020, se aprobaron los nuevos Estatutos de la Federación, en concordancia con la nueva Ley General de los Deportes, también se aprobó el Reglamento Disciplinario de la Federacion.

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2025 – 2028
- Lic. Carlos Armando Olmedo – Presidente
- Srita. Secia Carolina Rodríguez – Vicepresidenta
- Licda. Sandra Verónica González – Secretaria General
- Sr. Ronald Alexander Alfaro – Tesorero
- Licda. Ruth Carolina Gallardo – Primera Vocal
- Lic. Keylee Leonel Méndez – Segundo Vocal
- Sr. Jaime Alexander Blanco – Tercer Vocal
Por primera vez en la historia, la elección de la Junta Directiva permitió la participación con voz y voto de todos los miembros de la Federación, incluidos entrenadores, atletas y jueces que cumplen con los requisitos legales, además de representantes de clubes y asociaciones.

Por diversos motivos renuncian 3 directivos quedando conformada actualmente por los siguientes miembros:
- Lic. Carlos Armando Olmedo – Presidente
- Licda. Sandra Verónica González – Secretaria General
- Sr. Ronald Alexander Alfaro – Tesorero
- Sr. Jaime Alexander Blanco – Vocal


